Если работать напряму, то посмотри интерфейсы функций callfunc_ в amxmodx.inc. Если касаться банка, то можно не только напрямую вызывать функции модуля, но и вызывать обычные команды плагина в консоли сервера (но для этого команды в стороннем плагине должны быть зарегистрированы как консольные/серверные, а не чисто клиентские).
А вообще успех в данном случае во многом зависит от сотрудничества с разработчиком стороннего плагина.